[BACK]Return to wmain.c CVS log [TXT][DIR] Up to [local] / OpenXM / src / hgm / mh / src

Diff for /OpenXM/src/hgm/mh/src/wmain.c between version 1.18 and 1.31

version 1.18, 2014/03/14 02:21:40 version 1.31, 2016/02/13 22:56:50
Line 1 
Line 1 
 /*  /*
   $OpenXM: OpenXM/src/hgm/mh/src/wmain.c,v 1.17 2014/03/12 07:50:37 takayama Exp $    $OpenXM: OpenXM/src/hgm/mh/src/wmain.c,v 1.30 2016/02/13 05:55:09 takayama Exp $
   License: LGPL    License: LGPL
 */  */
 #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
Line 9 
Line 9 
 #include "sfile.h"  #include "sfile.h"
 #include "mh.h"  #include "mh.h"
 #define SMAX 4096  #define SMAX 4096
 #define inci(i) { i++; if (i >= argc) { fprintf(stderr,"Option argument is not given.\n"); return(NULL); }}  #define inci(i) { i++; if (i >= argc) { oxprintfe("Option argument is not given.\n"); return(NULL); }}
   #define VSTRING "%!version2.0"
 int MH_deallocate=0;  int MH_deallocate=0;
   
   /*
     changelog
     2016.02.13  code-n.c and code-n-2f1.c are linked together. New idata format.
     2016.02.04  MH_Ef_type  exponential or scalar factor
     2016.02.01  C_2F1
     2014.03.15  --strategy 1 is default. A new parser in setParam()
    */
 extern char *MH_Gfname;  extern char *MH_Gfname;
 extern char *MH_Dfname;  extern char *MH_Dfname;
   
Line 31  int MH_Dp;      /* Data sampling period */
Line 39  int MH_Dp;      /* Data sampling period */
 static double Xng=0.0;   /* the last point */  static double Xng=0.0;   /* the last point */
 int MH_RawName = 0;  int MH_RawName = 0;
 static int Testrank=0;  static int Testrank=0;
 extern int MH_Verbose;  /* If MH_success is set to 1, then strategy, MH_abserr, MH_relerr seem to
     be properly set.
   */
   int MH_success=0;
   /*
     Estimation of the maximal coeff of A in y'=Ay.
     This might be too rough estimate.
    */
   double MH_coeff_max;
   /*
     Estimation of h by MH_coeff_max;
    */
   double MH_estimated_start_step;
   
   int MH_P_pFq=1;
   int MH_Q_pFq=1;
   double *MH_A_pFq=NULL;
   double *MH_B_pFq=NULL;
   int MH_Ef_type=1;
   MH_RF mh_rf=NULL;  /* function pointer to mh_rf */
   
   extern int MH_Verbose;
   extern int MH_strategy;
   extern double MH_abserr;
   extern double MH_relerr;
   
 extern int MH_P95;  /* 95 % points */  extern int MH_P95;  /* 95 % points */
 int mh_gopen_file(void);  int mh_gopen_file(void);
 static int setParamTest(void);  static int setParamTest(void);
Line 41  static int setParamDefault(void);
Line 72  static int setParamDefault(void);
 static int setParam(char *fname);  static int setParam(char *fname);
 static int showParam(void);  static int showParam(void);
 static int next(struct SFILE *fp,char *s, char *msg);  static int next(struct SFILE *fp,char *s, char *msg);
   static double estimateHg(int m, double beta[],double x0);
   
   
 /* #define DEBUG */  /* #define DEBUG */
 #ifdef DEBUG  #ifdef DEBUG
 char *MH_Dfname; char *MH_Gfname; double MH_Hg;  char *MH_Dfname; char *MH_Gfname; double MH_Hg;
Line 55  void mh_freeWorkArea(void) {
Line 88  void mh_freeWorkArea(void) {
   mh_main(0,NULL);    mh_main(0,NULL);
   setParam(NULL);    setParam(NULL);
   mh_rkmain(0.0, NULL, 0.0);    mh_rkmain(0.0, NULL, 0.0);
   mh_rf(0.0, NULL, 0, NULL, 0);    if (mh_rf) (*mh_rf)(0.0, NULL, 0, NULL, 0);
   MH_deallocate=0; /* switch to the normal mode. */    MH_deallocate=0; /* switch to the normal mode. */
 }  }
 static int mypower(int x,int n) {  static int mypower(int x,int n) {
Line 65  static int mypower(int x,int n) {
Line 98  static int mypower(int x,int n) {
   return(a);    return(a);
 }  }
 #ifdef STANDALONE2  #ifdef STANDALONE2
 main(int argc,char *argv[]) {  int main(int argc,char *argv[]) {
   int strategy=STRATEGY_DEFAULT;    int strategy=STRATEGY_DEFAULT;
   double err[2]={-1.0,-1.0};    double err[2]={-1.0,-1.0};
   int i;    int i;
   for (i=1; i<argc; i++) {  
     if (strcmp(argv[i],"--strategy")==0) {  
       i++; sscanf(argv[i],"%d",&strategy);  
     }else if (strcmp(argv[i],"--abserr")==0) {  
       i++; sscanf(argv[i],"%lg",&(err[0]));  
     }else if (strcmp(argv[i],"--relerr")==0) {  
       i++; sscanf(argv[i],"%lg",&(err[1]));  
     }else ;  
   }  
   mh_set_strategy(strategy,err);  
   mh_exit(MH_RESET_EXIT); /* standalone mode */    mh_exit(MH_RESET_EXIT); /* standalone mode */
   /*  mh_main(argc,argv);    /*  mh_main(argc,argv);
       mh_freeWorkArea(); */        mh_freeWorkArea(); */
Line 95  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
Line 118  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
   struct MH_RESULT *rp=NULL;    struct MH_RESULT *rp=NULL;
   extern int MH_deallocate;    extern int MH_deallocate;
   extern int MH_byFile;    extern int MH_byFile;
     extern double Ef;
     Ef = 1;
   MH_byFile=1;    MH_byFile=1;
   if (MH_deallocate) { if (y0) mh_free(y0); return(rp); }    if (MH_deallocate) { if (y0) mh_free(y0); return(rp); }
   setParam(NULL); MH_Gfname = MH_Dfname = NULL; MH_Verbose=1;    setParam(NULL); MH_Gfname = MH_Dfname = NULL; MH_Verbose=1;
Line 130  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
Line 155  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
       MH_Verbose=1;        MH_Verbose=1;
     }else if (strcmp(argv[i],"--bystring")==0) {      }else if (strcmp(argv[i],"--bystring")==0) {
       MH_byFile = 0;        MH_byFile = 0;
         }else if (strcmp(argv[i],"--strategy")==0) {      }else if (strcmp(argv[i],"--strategy")==0) {
           i++; /* ignore */        i++; sscanf(argv[i],"%d",&MH_strategy);
         }else if (strcmp(argv[i],"--abserr")==0) {      }else if (strcmp(argv[i],"--abserr")==0) {
           i++; /* ignore */        i++; sscanf(argv[i],"%lg",&MH_abserr);
         }else if (strcmp(argv[i],"--relerr")==0) {      }else if (strcmp(argv[i],"--relerr")==0) {
           i++; /* ignore */        i++; sscanf(argv[i],"%lg",&MH_relerr);
     }else {      }else {
       fprintf(stderr,"Unknown option %s\n",argv[i]);        oxprintfe("Unknown option %s\n",argv[i]);
       mh_usage();        mh_usage();
       return(rp);        return(rp);
     }      }
   }    }
   if (MH_Verbose) showParam();  
   x0 = MH_X0g;    x0 = MH_X0g;
   xn = Xng;    xn = Xng;
   ef = Ef;    ef = Ef;
Line 150  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
Line 174  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
   y0 = (double *) mh_malloc(sizeof(double)*rank);    y0 = (double *) mh_malloc(sizeof(double)*rank);
   for (i=0; i<rank; i++) y0[i] = ef*Iv[i];    for (i=0; i<rank; i++) y0[i] = ef*Iv[i];
   mh_gopen_file();    mh_gopen_file();
   if (MH_Verbose) {for (i=0; i<rank; i++) printf("%lf\n",y0[i]); }  
   rp = (struct MH_RESULT*) mh_malloc(sizeof(struct MH_RESULT));    rp = (struct MH_RESULT*) mh_malloc(sizeof(struct MH_RESULT));
   rp->message = NULL;  
     if (MH_strategy) {
       if (MH_abserr > SIGDIGIT_DEFAULT*myabs(y0[0])) {
         MH_success = 0;
         oxprintfe("%%%%Warning, abserr seems not to be small enough, abserr=%lg, y[0]=%lg. Increasing the starting point (q0 or X0g(standalone case)) may help.\n",MH_abserr,y0[0]);
       }else{
         MH_success = 1;
       }
     }else{
       MH_success = 0;
     }
     MH_estimated_start_step = estimateHg(MH_Mg,MH_Beta,MH_X0g);
     if (MH_Verbose) showParam();
     if (MH_Verbose) {for (i=0; i<rank; i++) oxprintf("%lf\n",y0[i]); }
   
   *rp=mh_rkmain(x0,y0,xn);    *rp=mh_rkmain(x0,y0,xn);
   return(rp);    return(rp);
 }  }
   
 int mh_usage() {  int mh_usage() {
   fprintf(stderr,"Usages:\n");  
   fprintf(stderr,"hgm_w-n [--idata input_data_file --gnuplotf gnuplot_file_name\n");  #include "usage-w-n.h"
   fprintf(stderr," --dataf output_data_file --raw --xmax xmax --test m --step h]\n");  
   fprintf(stderr,"[ --95 --verbose] \n");    return(0);
   fprintf(stderr,"[ --strategy s --abserr ae --relerr re] \n");  
   fprintf(stderr,"s:0 rk, s:1 adaptive, s:2 adaptive&multiply, see rk.c for the default value of ae and re.\n");  
   fprintf(stderr,"--raw does not add data parameters to the output_data_file.\n");  
   fprintf(stderr,"\nThe command hgm_w-n [options] evaluates Pr({y | y<xmax}), which is the cumulative distribution function of the largest root of the m by m Wishart matrix with n degrees of freedom and the covariantce matrix sigma.\n");  
   fprintf(stderr,"All the eigenvalues of sigma must be simple.\n");  
   fprintf(stderr,"Parameters are specified by the input_data_file.\n");  
   fprintf(stderr,"The format of the input_data_file, which should be generated by the command hgm_jack-n.\n");  
   fprintf(stderr," MH_Mg: m, MH_Beta: beta=sigma^(-1)/2 (diagonized), MH_Ng: n, MH_X0g: starting value of x,\n");  
   fprintf(stderr," Iv: initial values at MH_X0g*MH_Beta (see our paper how to order them), \n");  
   fprintf(stderr," Ef: a scalar factor to the initial value. It may set to 1.\n");  
   fprintf(stderr," MH_Hg: h (step size),\n");  
   fprintf(stderr," MH_Dp: output data is stored in every MH_Dp steps when output_data_file is specified.\n");  
   fprintf(stderr," Xng: terminating value of x.\n");  
   fprintf(stderr," --95: output the 95%% point. --verbose: verbose mode.\n");  
   fprintf(stderr," The line started with %% is a comment line.\n");  
   fprintf(stderr," An example format of the input_data_file can be obtained by executing hgm_jack-n with no option.\n");  
   fprintf(stderr,"When --idata option is used, this command is quiet. Use --verbose option if you want to see some messages.\n");  
   fprintf(stderr,"\nExamples:\n");  
   fprintf(stderr,"[1] ./hgm_w-n \n");  
   fprintf(stderr,"[2] ./hgm_w-n --xmax 20\n");  
   fprintf(stderr,"[3] ./hgm_w-n --test 6\n");  
   fprintf(stderr,"   A test run in Mg=6.\n");  
   fprintf(stderr,"[4] ./hgm_jack-n --idata Testdata/tmp-idata3.txt --degree 15 >t.txt\n");  
   fprintf(stderr,"    ./hgm_w-n --idata t.txt --gnuplotf test-g\n");  
   fprintf(stderr,"    gnuplot -persist <test-g-gp.txt\n");  
   fprintf(stderr,"  tmp-idata3.txt is a sample input data distributed with this file.\n");  
   fprintf(stderr,"  test-g-gp.txt is an input file of the gnuplot\n");  
   fprintf(stderr,"  test-g is the table of x and the values of Pr({y | y<x}).\n");  
 }  }
   
 static int setParamTest() {  static int setParamTest() {
Line 210  static int setParamTest() {
Line 219  static int setParamTest() {
   MH_X0g = 0.3;    MH_X0g = 0.3;
   MH_Hg = 0.001;    MH_Hg = 0.001;
   MH_Dp = 1;    MH_Dp = 1;
   Xng = 10.0;    Xng = 10.0; return(0);
 }  }
 static int setParamDefault() {  static int setParamDefault() {
   int rank;    int rank;
     double a[1];
     double b[1];
   MH_M=MH_Mg = 2 ;    MH_M=MH_Mg = 2 ;
   MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);    MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);
   MH_Beta = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*MH_Mg);    MH_Beta = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*MH_Mg);
   MH_Beta[0] = 1.0; MH_Beta[1] = 2.0;    MH_Beta[0] = 1.0; MH_Beta[1] = 2.0;
   MH_Ng = (double *)mh_malloc(sizeof(double)); *MH_Ng = 3.0;    MH_Ng = (double *)mh_malloc(sizeof(double)); *MH_Ng = 3.0;
     a[0] = (MH_M+1.0)/2.0;
     b[0] = a[0]+(*MH_Ng)/2.0;
     mh_setA(a,1); mh_setB(b,1);
     mh_rf = & mh_rf_ef_type_1;
   Iv = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*rank);    Iv = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*rank);
   Iv[0] = 1.58693;    Iv[0] = 1.58693;
   Iv[1] = 0.811369;    Iv[1] = 0.811369;
Line 228  static int setParamDefault() {
Line 243  static int setParamDefault() {
   MH_X0g = 0.3;    MH_X0g = 0.3;
   MH_Hg = 0.001;    MH_Hg = 0.001;
   MH_Dp = 1;    MH_Dp = 1;
   Xng = 10.0;    Xng = 10.0; return(0);
 }  }
   #ifdef STANDALONE
 static int next(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {  /* may remove */
   static int next_old1(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {
   s[0] = '%';    s[0] = '%';
   while (s[0] == '%') {    while (s[0] == '%') {
     if (!mh_fgets(s,SMAX,sfp)) {      if (!mh_fgets(s,SMAX,sfp)) {
       fprintf(stderr,"Data format error at %s\n",msg);        oxprintfe("Data format error at %s\n",msg);
       mh_exit(-1);        mh_exit(-1);
     }      }
     if (s[0] != '%') return(0);      if (s[0] != '%') return(0);
     } return(0);
   }
   #endif
   static int next(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {
     static int check=1;
     char *ng="%%Ng=";
     // int i;
     s[0] = '%';
     while ((s[0] == '%') || (s[0] == '#')) {
       if (!mh_fgets(s,SMAX,sfp)) {
         oxprintfe("Data format error at %s\n",msg);
         oxprintfe("Is it version 2.0 format? If so, add\n%s\nat the top.\n",VSTRING);
         mh_exit(-1);
       }
           if ((s[0] == '%') && (s[1] == '%')) continue;
       if (s[0] == '#') continue;
       if (strncmp(s,VSTRING,strlen(VSTRING)) == 0) {
             return(2);
           }
       if (check && (strncmp(msg,ng,4)==0)) {
         if (strncmp(s,ng,5) != 0) {
           oxprintfe("Warning, there is no %%Ng= at the border of Beta's and Ng, s=%s\n",s);
         }
         /* check=0; */
       }
       if (s[0] != '%') return(0);
   }    }
     return(0);
 }  }
   
 static int setParam(char *fname) {  static int setParam(char *fname) {
   int rank;    int rank;
   char s[SMAX];    char s[SMAX];
   struct SFILE *fp;    struct SFILE *fp;
   int i;    int i;
     int version;
     double a[1]; double b[1]; /* for old inputs */
     struct mh_token tk;
   extern int MH_deallocate;    extern int MH_deallocate;
   extern int MH_byFile;    extern int MH_byFile;
   if (MH_deallocate) {    if (MH_deallocate) {
     if (MH_Beta) mh_free(MH_Beta);      if (MH_Beta) {mh_free(MH_Beta); MH_Beta=NULL;}
     if (MH_Ng) mh_free(MH_Ng);      if (MH_Ng) {mh_free(MH_Ng); MH_Ng=NULL;}
     if (Iv) mh_free(Iv);      if (Iv) {mh_free(Iv); Iv = NULL;}
           if (MH_A_pFq) {mh_free(MH_A_pFq); MH_A_pFq=NULL; MH_P_pFq = 0;}
           if (MH_B_pFq) {mh_free(MH_B_pFq); MH_B_pFq=NULL; MH_Q_pFq = 0;}
     return(0);      return(0);
   }    }
   if (fname == NULL) return(setParamDefault());    if (fname == NULL) return(setParamDefault());
   
   if ((fp=mh_fopen(fname,"r",MH_byFile)) == NULL) {    if ((fp=mh_fopen(fname,"r",MH_byFile)) == NULL) {
     fprintf(stderr,"File %s is not found.\n",fname);      oxprintfe("File %s is not found.\n",fname);
     mh_exit(-1);      mh_exit(-1);
   }    }
   next(fp,s,"MH_Mg(m)");    /* set default initial values */
     MH_Mg=MH_M=-1;  /* number of variables */
     MH_Ng=(double *) mh_malloc(sizeof(double)); *MH_Ng=-1; /* *Ng is the degree of freedom 1F1 */
     MH_X0g=0.1;   /* evaluation point */
     Ef=1.0;    /* exponential factor */
     MH_Ef_type=1;
     MH_Hg=0.01;   /* step size for RK */
     MH_Dp = 1;   /* sampling rate */
     Xng = 10.0; /* terminal point for RK */
   
     /* Parser for the old style (version <2.0) input */
     version=next(fp,s,"Mg(m)");
     if (version == 2) goto mh_myparse;
   sscanf(s,"%d",&MH_Mg); MH_M=MH_Mg;    sscanf(s,"%d",&MH_Mg); MH_M=MH_Mg;
   MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);    MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);
   
Line 270  static int setParam(char *fname) {
Line 331  static int setParam(char *fname) {
     sscanf(s,"%lf",&(MH_Beta[i]));      sscanf(s,"%lf",&(MH_Beta[i]));
   }    }
   
   MH_Ng = (double *)mh_malloc(sizeof(double));  
   next(fp,s,"MH_Ng(freedom parameter n)");    next(fp,s,"MH_Ng(freedom parameter n)");
   sscanf(s,"%lf",MH_Ng);    sscanf(s,"%lf",MH_Ng);
     /* for old style input only for 1F1 ef_type==1. */
     MH_P_pFq = 1; MH_Q_pFq = 1;
     a[0] = (MH_M+1.0)/2.0;
     b[0] = a[0]+(*MH_Ng)/2.0;
     mh_setA(a,1); mh_setB(b,1);
     mh_rf = & mh_rf_ef_type_1;
   
   
   next(fp,s,"MH_X0g(initial point)");    next(fp,s,"MH_X0g(initial point)");
   sscanf(s,"%lf",&MH_X0g);    sscanf(s,"%lf",&MH_X0g);
   
Line 294  static int setParam(char *fname) {
Line 361  static int setParam(char *fname) {
   
   next(fp,s,"Xng (the last point, cf. --xmax)");    next(fp,s,"Xng (the last point, cf. --xmax)");
   sscanf(s,"%lf",&Xng);    sscanf(s,"%lf",&Xng);
   mh_fclose(fp);  
     /* Reading the optional parameters */
    mh_myparse:
     while ((tk = mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_EOF) {
       /* expect ID */
       if (tk.type != MH_TOKEN_ID) {
         oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
       }
       if ((strcmp(s,"abserr")==0) || (strcmp(s,"abserror")==0)) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
           MH_abserr = tk.dval;
         }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
           MH_abserr = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         continue;
       }
       if ((strcmp(s,"relerr")==0) || (strcmp(s,"relerror")==0)) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
           MH_relerr = tk.dval;
         }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
           MH_relerr = tk.dval;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"strategy")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_strategy = tk.ival;
         continue;
       }
       // Format: #p_pFq=2  1.5  3.2   override by new input format.
       if (strcmp(s,"p_pFq")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_P_pFq = tk.ival;
             mh_setA(NULL,tk.ival); /* allocate mem */
         for (i=0; i<MH_P_pFq; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
             MH_A_pFq[i] = tk.dval;
           }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
             MH_A_pFq[i] = tk.ival;
           }else{
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
           }
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"q_pFq")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Q_pFq = tk.ival;
             mh_setB(NULL,tk.ival); /* allocate mem */
         for (i=0; i<MH_Q_pFq; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
             MH_B_pFq[i] = tk.dval;
           }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
             MH_B_pFq[i] = tk.ival;
           }else{
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
           }
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"ef_type")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Ef_type = tk.ival;
         continue;
       }
   
       if (strcmp(s,"Mg")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Mg = tk.ival;  MH_M = MH_Mg;
         MH_RANK = rank = mypower(2,MH_Mg);
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Beta")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
             if (MH_Mg <= 0) {
           oxprintfe("Mg should be set before reading Beta.\n"); mh_exit(-1);
         }
         MH_Beta = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*MH_Mg);
             for (i=0; i<MH_Mg; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
              MH_Beta[i] = tk.dval;
           }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
              MH_Beta[i] = tk.ival;
           }else {
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
           }
         }
         Iv = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*rank);
             for (i=0; i<rank; i++) {
                   Iv[i] = 0.0;
             }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Ng")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
   
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type== MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   *MH_Ng = tk.dval;
         }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
           *MH_Ng = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"X0g")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   MH_X0g = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   MH_X0g = tk.ival;
         }else{
                   oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
             }
         continue;
       }
           if (strcmp(s,"Iv")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
             for (i=0; i<rank; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                     Iv[i] = tk.dval;
                   }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                     Iv[i] = tk.ival;
           }else{
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
                   }
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Ef")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   Ef = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   Ef = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
             }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Hg")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   MH_Hg = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   MH_Hg = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Dp")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Dp = tk.dval;
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Xng")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   Xng = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   Xng = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
             }
         continue;
       }
   
       oxprintfe("Unknown ID for wmain.c (old...) at %s.\n",s);  mh_exit(-1);
     }
     if (MH_Ef_type == 1) {
           mh_rf = &mh_rf_ef_type_1;
     }else if (MH_Ef_type == 2) {
           mh_rf = &mh_rf_ef_type_2;
     }else{
           oxprintfe("Ef_type = %d is not implemented.\n",MH_Ef_type); mh_exit(-1);
     }
     if ((MH_M < 0) || (MH_A_pFq==NULL)) {
           oxprintfe("MH_M and p_pFq, q_pFq are compulsory parameters.\n"); mh_exit(-1);
     }
   
     mh_fclose(fp); return(0);
 }  }
   
 int showParam() {  static int showParam() {
   int rank,i;    int rank,i;
   extern int MH_strategy;    extern int MH_strategy;
   extern double MH_abserr;    extern double MH_abserr;
   extern double MH_relerr;    extern double MH_relerr;
   rank = mypower(2,MH_Mg);    rank = mypower(2,MH_Mg);
   printf("%%MH_Mg=\n%d\n",MH_Mg);    oxprintf("%%MH_Mg=\n%d\n",MH_Mg);
   for (i=0; i<MH_Mg; i++) {    for (i=0; i<MH_Mg; i++) {
     printf("%%MH_Beta[%d]=\n%lf\n",i,MH_Beta[i]);      oxprintf("%%MH_Beta[%d]=\n%lf\n",i,MH_Beta[i]);
   }    }
   printf("%%MH_Ng=\n%lf\n",*MH_Ng);    oxprintf("%%MH_Ng=\n%lf\n",*MH_Ng);
   printf("%%MH_X0g=\n%lf\n",MH_X0g);    oxprintf("%%MH_X0g=\n%lf\n",MH_X0g);
   for (i=0; i<rank; i++) {    for (i=0; i<rank; i++) {
     printf("%%Iv[%d]=\n%lg\n",i,Iv[i]);      oxprintf("%%Iv[%d]=\n%lg\n",i,Iv[i]);
   }    }
   printf("%%Ef=\n%lf\n",Ef);    oxprintf("%%Ef=\n%lf\n",Ef);
   printf("%%MH_Hg=\n%lf\n",MH_Hg);    oxprintf("%%MH_Hg=\n%lf\n",MH_Hg);
   printf("%%MH_Dp=\n%d\n",MH_Dp);    oxprintf("%%MH_Dp=\n%d\n",MH_Dp);
   printf("%%Xng=\n%lf\n",Xng);    oxprintf("%%Xng=\n%lf\n",Xng);
   printf("%%strategy=%d\n",MH_strategy);    oxprintf("%%strategy=%d\n",MH_strategy);
   printf("%%abserr=%lg, relerr=%lg\n",MH_abserr,MH_relerr);    oxprintf("%%abserr=%lg, %%relerr=%lg\n",MH_abserr,MH_relerr);
     oxprintf("#MH_success=%d\n",MH_success);
     oxprintf("#MH_coeff_max=%lg\n",MH_coeff_max);
     oxprintf("#MH_estimated_start_step=%lg\n",MH_estimated_start_step);
     oxprintf("%%ef_type=%d\n",MH_Ef_type);
     oxprintf("%%q_pFq=%d, ",MH_P_pFq);
     for (i=0; i<MH_P_pFq; i++) {
       if (i != MH_P_pFq-1) oxprintf(" %lg,",MH_A_pFq[i]);
       else oxprintf(" %lg\n",MH_A_pFq[i]);
     }
     oxprintf("%%q_pFq=%d, ",MH_Q_pFq);
     for (i=0; i<MH_Q_pFq; i++) {
       if (i != MH_Q_pFq-1) oxprintf(" %lg,",MH_B_pFq[i]);
       else oxprintf(" %lg\n",MH_B_pFq[i]);
     }
     return(0);
 }  }
   
   static double estimateHg(int m, double beta[],double x0) {
     int i,j;
     double dmin;
     double cmax;
     double h;
     /* mynote on 2014.03.15 */
     if (m>1) dmin = myabs(beta[1]-beta[0]);
     else dmin=myabs(beta[0]);
     for (i=0; i<m; i++) {
       for (j=i+1; j<m; j++) {
         if (myabs(beta[i]-beta[j]) < dmin) dmin = myabs(beta[i]-beta[j]);
       }
     }
     dmin = dmin*x0*2;
     cmax = 1.0;
     for (i=0; i<m; i++) cmax = cmax*dmin;
     cmax = 1.0/cmax;
     MH_coeff_max=cmax;
     h = exp(log(MH_abserr/cmax)/5.0);
     MH_estimated_start_step = h;
     return h;
   }
   
   void mh_setA(double a[],int alen) {
     int i;
     if (alen < 0) {
           if (MH_A_pFq != NULL) mh_free(MH_A_pFq);
           MH_A_pFq=NULL; MH_P_pFq=-1;
           return;
     }
     if (alen == 0) {
           MH_P_pFq=0; return;
     }
     MH_P_pFq=alen;
     MH_A_pFq = (double *)mh_malloc(MH_P_pFq*sizeof(double));
     if (a != NULL) {
           for (i=0; i<alen; i++) MH_A_pFq[i] = a[i];
     }else{
           for (i=0; i<alen; i++) MH_A_pFq[i] = 0.0;
     }
     return;
   }
   void mh_setB(double b[],int blen) {
     int i;
     if (blen < 0) {
           if (MH_B_pFq != NULL) mh_free(MH_B_pFq);
           MH_B_pFq=NULL; MH_Q_pFq=-1;
           return;
     }
     if (blen == 0) {
           MH_Q_pFq=0; return;
     }
     MH_Q_pFq=blen;
     MH_B_pFq = (double *)mh_malloc(MH_Q_pFq*sizeof(double));
     if (b != NULL) {
           for (i=0; i<blen; i++) MH_B_pFq[i] = b[i];
     }else{
           for (i=0; i<blen; i++) MH_B_pFq[i] = 0.0;
     }
     return;
   }
Legend:
Removed from v.1.18  
changed lines
  Added in v.1.31
FreeBSD-CVSweb <freebsd-cvsweb@FreeBSD.org>