[BACK]Return to wmain.c CVS log [TXT][DIR] Up to [local] / OpenXM / src / hgm / mh / src

Diff for /OpenXM/src/hgm/mh/src/wmain.c between version 1.22 and 1.36

version 1.22, 2015/03/24 05:59:43 version 1.36, 2016/06/06 04:49:11
Line 1 
Line 1 
 /*  /*
   $OpenXM: OpenXM/src/hgm/mh/src/wmain.c,v 1.21 2014/03/20 10:58:37 takayama Exp $    $OpenXM: OpenXM/src/hgm/mh/src/wmain.c,v 1.35 2016/06/04 07:52:14 takayama Exp $
   License: LGPL    License: LGPL
 */  */
 #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
Line 10 
Line 10 
 #include "mh.h"  #include "mh.h"
 #define SMAX 4096  #define SMAX 4096
 #define inci(i) { i++; if (i >= argc) { oxprintfe("Option argument is not given.\n"); return(NULL); }}  #define inci(i) { i++; if (i >= argc) { oxprintfe("Option argument is not given.\n"); return(NULL); }}
   #define VSTRING "%!version2.0"
 int MH_deallocate=0;  int MH_deallocate=0;
   
 /*  /*
   changelog    changelog
     2016.02.13  code-n.c and code-n-2f1.c are linked together. New idata format.
     2016.02.04  MH_Ef_type  exponential or scalar factor
     2016.02.01  C_2F1
   2014.03.15  --strategy 1 is default. A new parser in setParam()    2014.03.15  --strategy 1 is default. A new parser in setParam()
  */   */
 extern char *MH_Gfname;  extern char *MH_Gfname;
Line 48  double MH_coeff_max;
Line 52  double MH_coeff_max;
   Estimation of h by MH_coeff_max;    Estimation of h by MH_coeff_max;
  */   */
 double MH_estimated_start_step;  double MH_estimated_start_step;
   
   int MH_P_pFq=1;
   int MH_Q_pFq=1;
   double *MH_A_pFq=NULL;
   double *MH_B_pFq=NULL;
   int MH_Ef_type=1;
   MH_RF mh_rf=NULL;  /* function pointer to mh_rf */
   
 extern int MH_Verbose;  extern int MH_Verbose;
 extern int MH_strategy;  extern int MH_strategy;
 extern double MH_abserr;  extern double MH_abserr;
Line 62  static int showParam(void);
Line 74  static int showParam(void);
 static int next(struct SFILE *fp,char *s, char *msg);  static int next(struct SFILE *fp,char *s, char *msg);
 static double estimateHg(int m, double beta[],double x0);  static double estimateHg(int m, double beta[],double x0);
   
   
 /* #define DEBUG */  /* #define DEBUG */
 #ifdef DEBUG  #ifdef DEBUG
 char *MH_Dfname; char *MH_Gfname; double MH_Hg;  char *MH_Dfname; char *MH_Gfname; double MH_Hg;
Line 75  void mh_freeWorkArea(void) {
Line 88  void mh_freeWorkArea(void) {
   mh_main(0,NULL);    mh_main(0,NULL);
   setParam(NULL);    setParam(NULL);
   mh_rkmain(0.0, NULL, 0.0);    mh_rkmain(0.0, NULL, 0.0);
   mh_rf(0.0, NULL, 0, NULL, 0);    if (mh_rf) (*mh_rf)(0.0, NULL, 0, NULL, 0);
   MH_deallocate=0; /* switch to the normal mode. */    MH_deallocate=0; /* switch to the normal mode. */
 }  }
 static int mypower(int x,int n) {  static int mypower(int x,int n) {
Line 85  static int mypower(int x,int n) {
Line 98  static int mypower(int x,int n) {
   return(a);    return(a);
 }  }
 #ifdef STANDALONE2  #ifdef STANDALONE2
 main(int argc,char *argv[]) {  int main(int argc,char *argv[]) {
   int strategy=STRATEGY_DEFAULT;    int strategy=STRATEGY_DEFAULT;
   double err[2]={-1.0,-1.0};    double err[2]={-1.0,-1.0};
   int i;    int i;
Line 105  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
Line 118  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
   struct MH_RESULT *rp=NULL;    struct MH_RESULT *rp=NULL;
   extern int MH_deallocate;    extern int MH_deallocate;
   extern int MH_byFile;    extern int MH_byFile;
     extern double Ef;
     Ef = 1;
   MH_byFile=1;    MH_byFile=1;
   if (MH_deallocate) { if (y0) mh_free(y0); return(rp); }    if (MH_deallocate) { if (y0) mh_free(y0); return(rp); }
   setParam(NULL); MH_Gfname = MH_Dfname = NULL; MH_Verbose=1;    setParam(NULL); MH_Gfname = MH_Dfname = NULL; MH_Verbose=1;
Line 164  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
Line 179  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
   if (MH_strategy) {    if (MH_strategy) {
     if (MH_abserr > SIGDIGIT_DEFAULT*myabs(y0[0])) {      if (MH_abserr > SIGDIGIT_DEFAULT*myabs(y0[0])) {
       MH_success = 0;        MH_success = 0;
       oxprintfe("%%%%Warning, abserr seems not to be small enough, abserr=%lg, y[0]=%lg\n",MH_abserr,y0[0]);        oxprintfe("%%%%Warning, abserr seems not to be small enough, abserr=%lg, y[0]=%lg. Increasing the starting point (q0 or X0g(standalone case)) may or making abserr (err[1] or abserror(standalone case))  smaller will help, e.g., err=c(%lg,1e-10)\n",MH_abserr,y0[0],y0[0]*(1e-6));
     }else{      }else{
       MH_success = 1;        MH_success = 1;
     }      }
Line 180  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
Line 195  struct MH_RESULT *mh_main(int argc,char *argv[]) {
 }  }
   
 int mh_usage() {  int mh_usage() {
   oxprintfe("Usages:\n");  
   oxprintfe("hgm_w-n [--idata input_data_file --gnuplotf gnuplot_file_name\n");  #include "usage-w-n.h"
   oxprintfe(" --dataf output_data_file --raw --xmax xmax --test m --step h]\n");  
   oxprintfe("[ --95 --verbose] \n");    return(0);
   oxprintfe("[ --strategy s --abserr ae --relerr re] \n");  
   oxprintfe("s:0 rk, s:1 adaptive, s:2 adaptive&multiply, see rk.c for the default value of ae and re.\n");  
   oxprintfe("strategy default = %d\n",MH_strategy);  
   oxprintfe("--raw does not add data parameters to the output_data_file.\n");  
   oxprintfe("\nThe command hgm_w-n [options] evaluates Pr({y | y<xmax}), which is the cumulative distribution function of the largest root of the m by m Wishart matrix with n degrees of freedom and the covariantce matrix sigma.\n");  
   oxprintfe("All the eigenvalues of sigma must be simple.\n");  
   oxprintfe("Parameters are specified by the input_data_file.\n");  
   oxprintfe("Parameters are redefined when they appear more than once in the idata file and the command line options.\n");  
   oxprintfe("The format of the input_data_file, which should be generated by the command hgm_jack-n.\n");  
   oxprintfe(" MH_Mg: m, MH_Beta: beta=sigma^(-1)/2 (diagonized), MH_Ng: n, MH_X0g: starting value of x,\n");  
   oxprintfe(" Iv: initial values at MH_X0g*MH_Beta (see our paper how to order them), \n");  
   oxprintfe(" Ef: a scalar factor to the initial value. It may set to 1.\n");  
   oxprintfe(" MH_Hg: h (step size),\n");  
   oxprintfe(" MH_Dp: output data is stored in every MH_Dp steps when output_data_file is specified.\n");  
   oxprintfe(" Xng: terminating value of x.\n\n");  
   oxprintfe("--95: output the 95%% point. --verbose: verbose mode.\n");  
   oxprintfe("The line started with %%%% or # is a comment line.\n");  
   oxprintfe("An example format of the input_data_file can be obtained by executing hgm_jack-n with no option.\n");  
   oxprintfe("When --idata option is used, this command is quiet. Use --verbose option if you want to see some messages.\n");  
   oxprintfe("\nExamples:\n");  
   oxprintfe("[1] ./hgm_w-n \n");  
   oxprintfe("[2] ./hgm_w-n --xmax 20\n");  
   oxprintfe("[3] ./hgm_w-n --test 6\n");  
   oxprintfe("   A test run in Mg=6.\n");  
   oxprintfe("[4] ./hgm_jack-n --idata Testdata/tmp-idata3.txt >t.txt\n");  
   oxprintfe("    ./hgm_w-n --idata t.txt --gnuplotf test-g --verbose\n");  
   oxprintfe("    gnuplot -persist <test-g-gp.txt\n");  
   oxprintfe("  tmp-idata3.txt is a sample input data distributed with this file.\n");  
   oxprintfe("  test-g-gp.txt is an input file of the gnuplot\n");  
   oxprintfe("  test-g is the table of x and the values of Pr({y | y<x}).\n");  
 }  }
   
 static int setParamTest() {  static int setParamTest() {
Line 234  static int setParamTest() {
Line 219  static int setParamTest() {
   MH_X0g = 0.3;    MH_X0g = 0.3;
   MH_Hg = 0.001;    MH_Hg = 0.001;
   MH_Dp = 1;    MH_Dp = 1;
   Xng = 10.0;    Xng = 10.0; return(0);
 }  }
 static int setParamDefault() {  static int setParamDefault() {
   int rank;    int rank;
     double a[1];
     double b[1];
   MH_M=MH_Mg = 2 ;    MH_M=MH_Mg = 2 ;
   MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);    MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);
   MH_Beta = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*MH_Mg);    MH_Beta = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*MH_Mg);
   MH_Beta[0] = 1.0; MH_Beta[1] = 2.0;    MH_Beta[0] = 1.0; MH_Beta[1] = 2.0;
   MH_Ng = (double *)mh_malloc(sizeof(double)); *MH_Ng = 3.0;    MH_Ng = (double *)mh_malloc(sizeof(double)); *MH_Ng = 3.0;
     a[0] = (MH_M+1.0)/2.0;
     b[0] = a[0]+(*MH_Ng)/2.0;
     mh_setA(a,1); mh_setB(b,1);
     mh_rf = & mh_rf_ef_type_1;
   Iv = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*rank);    Iv = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*rank);
   Iv[0] = 1.58693;    Iv[0] = 1.58693;
   Iv[1] = 0.811369;    Iv[1] = 0.811369;
Line 251  static int setParamDefault() {
Line 242  static int setParamDefault() {
   Ef = 0.01034957388338225707;    Ef = 0.01034957388338225707;
   MH_X0g = 0.3;    MH_X0g = 0.3;
   MH_Hg = 0.001;    MH_Hg = 0.001;
   MH_Dp = 1;    MH_Dp = 1000;
   Xng = 10.0;    Xng = 10.0; return(0);
 }  }
   #ifdef STANDALONE
 static int next(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {  /* may remove */
   static int next_old1(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {
   s[0] = '%';    s[0] = '%';
   while (s[0] == '%') {    while (s[0] == '%') {
     if (!mh_fgets(s,SMAX,sfp)) {      if (!mh_fgets(s,SMAX,sfp)) {
Line 263  static int next(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {
Line 255  static int next(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {
       mh_exit(-1);        mh_exit(-1);
     }      }
     if (s[0] != '%') return(0);      if (s[0] != '%') return(0);
     } return(0);
   }
   #endif
   static int next(struct SFILE *sfp,char *s,char *msg) {
     static int check=1;
     char *ng="%%Ng=";
     // int i;
     s[0] = '%';
     while ((s[0] == '%') || (s[0] == '#')) {
       if (!mh_fgets(s,SMAX,sfp)) {
         oxprintfe("Data format error at %s\n",msg);
         oxprintfe("Is it version 2.0 format? If so, add\n%s\nat the top.\n",VSTRING);
         mh_exit(-1);
       }
           if ((s[0] == '%') && (s[1] == '%')) continue;
       if (s[0] == '#') continue;
       if (strncmp(s,VSTRING,strlen(VSTRING)) == 0) {
             return(2);
           }
       if (check && (strncmp(msg,ng,4)==0)) {
         if (strncmp(s,ng,5) != 0) {
           oxprintfe("Warning, there is no %%Ng= at the border of Beta's and Ng, s=%s\n",s);
         }
         /* check=0; */
       }
       if (s[0] != '%') return(0);
   }    }
     return(0);
 }  }
   
 static int setParam(char *fname) {  static int setParam(char *fname) {
   int rank;    int rank;
   char s[SMAX];    char s[SMAX];
   struct SFILE *fp;    struct SFILE *fp;
   int i;    int i;
     int version;
     double a[1]; double b[1]; /* for old inputs */
   struct mh_token tk;    struct mh_token tk;
   extern int MH_deallocate;    extern int MH_deallocate;
   extern int MH_byFile;    extern int MH_byFile;
   if (MH_deallocate) {    if (MH_deallocate) {
     if (MH_Beta) mh_free(MH_Beta);      if (MH_Beta) {mh_free(MH_Beta); MH_Beta=NULL;}
     if (MH_Ng) mh_free(MH_Ng);      if (MH_Ng) {mh_free(MH_Ng); MH_Ng=NULL;}
     if (Iv) mh_free(Iv);      if (Iv) {mh_free(Iv); Iv = NULL;}
           if (MH_A_pFq) {mh_free(MH_A_pFq); MH_A_pFq=NULL; MH_P_pFq = 0;}
           if (MH_B_pFq) {mh_free(MH_B_pFq); MH_B_pFq=NULL; MH_Q_pFq = 0;}
     return(0);      return(0);
   }    }
   if (fname == NULL) return(setParamDefault());    if (fname == NULL) return(setParamDefault());
Line 285  static int setParam(char *fname) {
Line 309  static int setParam(char *fname) {
     oxprintfe("File %s is not found.\n",fname);      oxprintfe("File %s is not found.\n",fname);
     mh_exit(-1);      mh_exit(-1);
   }    }
   next(fp,s,"MH_Mg(m)");    /* set default initial values */
     MH_Mg=MH_M=-1;  /* number of variables */
     MH_Ng=(double *) mh_malloc(sizeof(double)); *MH_Ng=-1; /* *Ng is the degree of freedom 1F1 */
     MH_X0g=0.1;   /* evaluation point */
     Ef=1.0;    /* exponential factor */
     MH_Ef_type=1;
     MH_Hg=0.01;   /* step size for RK */
     MH_Dp = -1;   /* sampling rate */
     Xng = 10.0; /* terminal point for RK */
   
     /* Parser for the old style (version <2.0) input */
     version=next(fp,s,"Mg(m)");
     if (version == 2) goto mh_myparse;
   sscanf(s,"%d",&MH_Mg); MH_M=MH_Mg;    sscanf(s,"%d",&MH_Mg); MH_M=MH_Mg;
   MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);    MH_RANK=rank = mypower(2,MH_Mg);
   
Line 295  static int setParam(char *fname) {
Line 331  static int setParam(char *fname) {
     sscanf(s,"%lf",&(MH_Beta[i]));      sscanf(s,"%lf",&(MH_Beta[i]));
   }    }
   
   MH_Ng = (double *)mh_malloc(sizeof(double));  
   next(fp,s,"MH_Ng(freedom parameter n)");    next(fp,s,"MH_Ng(freedom parameter n)");
   sscanf(s,"%lf",MH_Ng);    sscanf(s,"%lf",MH_Ng);
     /* for old style input only for 1F1 ef_type==1. */
     MH_P_pFq = 1; MH_Q_pFq = 1;
     a[0] = (MH_M+1.0)/2.0;
     b[0] = a[0]+(*MH_Ng)/2.0;
     mh_setA(a,1); mh_setB(b,1);
     mh_rf = & mh_rf_ef_type_1;
   
   
   next(fp,s,"MH_X0g(initial point)");    next(fp,s,"MH_X0g(initial point)");
   sscanf(s,"%lf",&MH_X0g);    sscanf(s,"%lf",&MH_X0g);
   
Line 321  static int setParam(char *fname) {
Line 363  static int setParam(char *fname) {
   sscanf(s,"%lf",&Xng);    sscanf(s,"%lf",&Xng);
   
   /* Reading the optional parameters */    /* Reading the optional parameters */
    mh_myparse:
   while ((tk = mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_EOF) {    while ((tk = mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_EOF) {
     /* expect ID */      /* expect ID */
     if (tk.type != MH_TOKEN_ID) {      if (tk.type != MH_TOKEN_ID) {
Line 330  static int setParam(char *fname) {
Line 373  static int setParam(char *fname) {
       if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {        if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
         oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);          oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
       }        }
       if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_DOUBLE) {        if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
           MH_abserr = tk.dval;
         }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
           MH_abserr = tk.ival;
         }else{
         oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);          oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
       }        }
       MH_abserr = tk.dval;  
       continue;        continue;
     }      }
     if ((strcmp(s,"relerr")==0) || (strcmp(s,"relerror")==0)) {      if ((strcmp(s,"relerr")==0) || (strcmp(s,"relerror")==0)) {
       if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {        if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
         oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);          oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
       }        }
       if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_DOUBLE) {        if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
           MH_relerr = tk.dval;
         }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
           MH_relerr = tk.dval;
         }else{
         oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);          oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
       }        }
       MH_relerr = tk.dval;  
       continue;        continue;
     }      }
     if (strcmp(s,"strategy")==0) {      if (strcmp(s,"strategy")==0) {
Line 356  static int setParam(char *fname) {
Line 405  static int setParam(char *fname) {
       MH_strategy = tk.ival;        MH_strategy = tk.ival;
       continue;        continue;
     }      }
     oxprintfe("Unknown ID at %s\n",s); mh_exit(-1);      // Format: #p_pFq=2  1.5  3.2   override by new input format.
       if (strcmp(s,"p_pFq")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_P_pFq = tk.ival;
             mh_setA(NULL,tk.ival); /* allocate mem */
         for (i=0; i<MH_P_pFq; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
             MH_A_pFq[i] = tk.dval;
           }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
             MH_A_pFq[i] = tk.ival;
           }else{
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
           }
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"q_pFq")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Q_pFq = tk.ival;
             mh_setB(NULL,tk.ival); /* allocate mem */
         for (i=0; i<MH_Q_pFq; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
             MH_B_pFq[i] = tk.dval;
           }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
             MH_B_pFq[i] = tk.ival;
           }else{
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
           }
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"ef_type")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Ef_type = tk.ival;
         continue;
       }
   
       if (strcmp(s,"Mg")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Mg = tk.ival;  MH_M = MH_Mg;
         MH_RANK = rank = mypower(2,MH_Mg);
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Beta")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
             if (MH_Mg <= 0) {
           oxprintfe("Mg should be set before reading Beta.\n"); mh_exit(-1);
         }
         MH_Beta = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*MH_Mg);
             for (i=0; i<MH_Mg; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
              MH_Beta[i] = tk.dval;
           }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
              MH_Beta[i] = tk.ival;
           }else {
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
           }
         }
         Iv = (double *)mh_malloc(sizeof(double)*rank);
             for (i=0; i<rank; i++) {
                   Iv[i] = 0.0;
             }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Ng")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
   
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type== MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   *MH_Ng = tk.dval;
         }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
           *MH_Ng = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"X0g")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   MH_X0g = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   MH_X0g = tk.ival;
         }else{
                   oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
             }
         continue;
       }
           if (strcmp(s,"Iv")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
             for (i=0; i<rank; i++) {
           if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                     Iv[i] = tk.dval;
                   }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                     Iv[i] = tk.ival;
           }else{
             oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
                   }
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Ef")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   Ef = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   Ef = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
             }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Hg")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   MH_Hg = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   MH_Hg = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Dp")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type != MH_TOKEN_INT) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         MH_Dp = tk.dval;
         continue;
       }
       if (strcmp(s,"Xng")==0) {
         if (mh_getoken(s,SMAX-1,fp).type != MH_TOKEN_EQ) {
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
         }
         if ((tk=mh_getoken(s,SMAX-1,fp)).type == MH_TOKEN_DOUBLE) {
                   Xng = tk.dval;
             }else if (tk.type == MH_TOKEN_INT) {
                   Xng = tk.ival;
         }else{
           oxprintfe("Syntax error at %s\n",s); mh_exit(-1);
             }
         continue;
       }
   
       oxprintfe("Unknown ID for wmain.c (old...) at %s.\n",s);  mh_exit(-1);
   }    }
     if (MH_Ef_type == 1) {
           mh_rf = &mh_rf_ef_type_1;
     }else if (MH_Ef_type == 2) {
           mh_rf = &mh_rf_ef_type_2;
     }else{
           oxprintfe("Ef_type = %d is not implemented.\n",MH_Ef_type); mh_exit(-1);
     }
     if ((MH_M < 0) || (MH_A_pFq==NULL)) {
           oxprintfe("MH_M and p_pFq, q_pFq are compulsory parameters.\n"); mh_exit(-1);
     }
     if (MH_Dp < 0) MH_Dp = (int) floor(1/MH_Hg);
     if (MH_P95 && (MH_Dp*MH_Hg < 2.0)) {
           oxprintfe("%%%%Warning, the resolution to find 95 percent point is less than 2.0. Decrease Dp\n");
     }
   
   mh_fclose(fp);    mh_fclose(fp); return(0);
 }  }
   
 static int showParam() {  static int showParam() {
Line 385  static int showParam() {
Line 626  static int showParam() {
   oxprintf("%%abserr=%lg, %%relerr=%lg\n",MH_abserr,MH_relerr);    oxprintf("%%abserr=%lg, %%relerr=%lg\n",MH_abserr,MH_relerr);
   oxprintf("#MH_success=%d\n",MH_success);    oxprintf("#MH_success=%d\n",MH_success);
   oxprintf("#MH_coeff_max=%lg\n",MH_coeff_max);    oxprintf("#MH_coeff_max=%lg\n",MH_coeff_max);
   oxprintf("#MH_estimated_start_step=%lg\n",MH_estimated_start_step);    oxprintf("#MH_estimated_start_step=%lg\n",MH_estimated_start_step);
     oxprintf("%%ef_type=%d\n",MH_Ef_type);
     oxprintf("%%q_pFq=%d, ",MH_P_pFq);
     for (i=0; i<MH_P_pFq; i++) {
       if (i != MH_P_pFq-1) oxprintf(" %lg,",MH_A_pFq[i]);
       else oxprintf(" %lg\n",MH_A_pFq[i]);
     }
     oxprintf("%%q_pFq=%d, ",MH_Q_pFq);
     for (i=0; i<MH_Q_pFq; i++) {
       if (i != MH_Q_pFq-1) oxprintf(" %lg,",MH_B_pFq[i]);
       else oxprintf(" %lg\n",MH_B_pFq[i]);
     }
     return(0);
 }  }
   
 static double estimateHg(int m, double beta[],double x0) {  static double estimateHg(int m, double beta[],double x0) {
Line 409  static double estimateHg(int m, double beta[],double x
Line 662  static double estimateHg(int m, double beta[],double x
   h = exp(log(MH_abserr/cmax)/5.0);    h = exp(log(MH_abserr/cmax)/5.0);
   MH_estimated_start_step = h;    MH_estimated_start_step = h;
   return h;    return h;
   }
   
   void mh_setA(double a[],int alen) {
     int i;
     if (alen < 0) {
           if (MH_A_pFq != NULL) mh_free(MH_A_pFq);
           MH_A_pFq=NULL; MH_P_pFq=-1;
           return;
     }
     if (alen == 0) {
           MH_P_pFq=0; return;
     }
     MH_P_pFq=alen;
     MH_A_pFq = (double *)mh_malloc(MH_P_pFq*sizeof(double));
     if (a != NULL) {
           for (i=0; i<alen; i++) MH_A_pFq[i] = a[i];
     }else{
           for (i=0; i<alen; i++) MH_A_pFq[i] = 0.0;
     }
     return;
   }
   void mh_setB(double b[],int blen) {
     int i;
     if (blen < 0) {
           if (MH_B_pFq != NULL) mh_free(MH_B_pFq);
           MH_B_pFq=NULL; MH_Q_pFq=-1;
           return;
     }
     if (blen == 0) {
           MH_Q_pFq=0; return;
     }
     MH_Q_pFq=blen;
     MH_B_pFq = (double *)mh_malloc(MH_Q_pFq*sizeof(double));
     if (b != NULL) {
           for (i=0; i<blen; i++) MH_B_pFq[i] = b[i];
     }else{
           for (i=0; i<blen; i++) MH_B_pFq[i] = 0.0;
     }
     return;
 }  }
Legend:
Removed from v.1.22  
changed lines
  Added in v.1.36
FreeBSD-CVSweb <freebsd-cvsweb@FreeBSD.org>